Prevista na Lei Estadual 7.655/62, de 28.12.1962, que criou a Universidade Estadual de Campinas, a Reitoria é o órgão superior de administração da universidade, juntamente com o Conselho Universitário (CONSU), e tem a finalidade de superintender todas as atividades universitárias. Suas funções são exercidas pelo Reitor, que é auxiliado pelo Coordenador Geral da Universidade e pelos Pró-Reitores.

Previsto na Lei 7.655/1962, de criação da Unicamp, o Conselho de Curadores (CC) teve sua primeira reunião em 1963, presidida pelo reitor Cantídio de Moura Campos, enquanto a última reunião aconteceu em 1965, sob a presidência do professor Zeferino Vaz. Seu funcionamento se deu na condição de que suas funções seriam exercidas até a formação de um Conselho Diretor. Era o órgão deliberativo da Unicamp e tinha como competências, dentre outras, exercer a jurisdição superior da Universidade, traçar sua política geral e fiscalizar também a execução orçamentária e deliberar sobre a prestação de contas do reitor.

A Assessoria Econômica (AECO) foi criada junto ao Gabinete do Reitor (GR) pela Portaria GR 95/94, de 25.07.1994 e extinta pela Portaria GR 97/97, de 16.07.1997, sendo substituída pela Assessoria de Economia e Planejamento (AEPLAN). Tinha como competências acompanhar e consolidar os indicadores físicos da Universidade assessorar a Reitoria nos assuntos relativos à política salarial acompanhar e manter atualizado o banco de dados de indicadores econômicos além de elaborar e/ou assessorar projetos especiais, na sua área de atuação, quando solicitado pelo reitor.

Fundado em março de 1955, o Conselho de Entidades de Campinas (CEC) agregava as sociedades de classe, culturais e de serviços da cidade, a fim de debater assuntos de interesse coletivo da sociedade campineira e viabilizar decisões decorrentes desses debates. O Conselho decidiu tratar da questão relacionada à Faculdade de Medicina de Campinas, criada pela Lei 2.154/1953, mas até então não implantada. Retomou a Campanha Pró-instalação da Faculdade de Medicina na cidade, idealizada pelo jornalista Luso Ventura em 1946. A intensa mobilização junto ao governo do Estado e à Assembleia Legislativa levou à instalação da Unicamp em 1962, por meio da Lei Estadual 7.655/1962.

Prevista nos Estatutos da Unicamp, baixados pelo Decreto Estadual 52.255/1969, a Coordenadoria Geral das Faculdades (CGF) tinha como função colaborar diretamente na administração da Universidade, além de responder pelas atividades de extensão e pelos convênios referentes às atividades culturais, técnicas e científicas. Extinta pelo Decreto Estadual 25.212/1986, suas atribuições foram automaticamente revogadas e assumidas pela atual Pró-reitoria de Extensão, Esporte e Cultura (ProEEC).

A Coordenadoria de Desenvolvimento Cultural (CDC) foi criada junto à então Pró-reitoria de Extensão e Assuntos Comunitários (PREAC), atual Pró-reitoria de Extensão, Esporte e Cultura (ProEEC), em substituição à Assessoria de Apoio a Eventos (APEU) e ao Escritório de Ação Cultural (EAC), conforme Portaria GR-044/1999. O objetivo era elaborar políticas de desenvolvimento cultural para a Universidade, promover, oferecer e difundir projetos de produção e difusão cultural para o público em geral, prestar apoio técnico e administrativo a eventos e iniciativas extracurriculares, administrar o Centro de Convenções e o Ginásio Multidisciplinar. Vinte anos depois, por meio da Deliberação CONSU-A-017/2019, foi criada a Diretoria de Cultura (DCult), que abrangeu, entre outros órgãos, o Centro de Convenções e o Ginásio Multidisciplinar da Unicamp, o que levou à extinção da CDC.

Previsto na Lei Estadual que criou a Unicamp por intermédio da Lei 7.655/1962, o Instituto de Física obteve autorização para instalação e funcionamento por meio da Resolução CEE 46/1966. Suas atividades tiveram início em 1967, quando foram contratados os primeiros docentes. O curso de pós-graduação iniciou-se a partir de 1970. O atual nome do Instituto foi uma homenagem prestada em 1971 ao físico Gleb Wataghin, que emigrou para o Brasil e foi uma das pessoas responsáveis pelo estabelecimento da física experimental como atividade científica no país. De acordo com a Deliberação CONSU-A-026/2013, o IFGW é formado pelos departamentos de Raios Cósmicos e Cronologia, Física da Matéria Condensada, Eletrônica Quântica e Física Aplicada.

Inicialmente denominado Instituto de Matemática e previsto na Lei Estadual 7.655/62, de 28.12.1962, que criou a Universidade Estadual de Campinas, o o Instituto de Matemática, Estatística e Ciência da Computação teve autorização para instalação e funcionamento com a Resolução CEE 46/66, de 19.12.1966, mas sua implantação definitiva teve início apenas a partir de 1968. Com o desmembramento do Departamento de Ciência da Computação (DCC), que deixou de fazer parte do IMECC para tornar-se uma unidade independente em março de 1996, o Instituto de Matemática, Estatística e Ciência da Computação teve seu nome alterado para Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica e a sigla IMECC pode ser mantida. De acordo com a Portaria GR 82/86, o IMECC está diretamente diretamente subordinado à reitoria e tem por finalidade desenvolver o ensino, a pesquisa e a prestação de serviços à comunidade, conforme disposto no Regimento Geral da Universidade.

O Colégio Técnico de Limeira (COTIL) foi criado pela Lei 7.655/1962 e autorizado a se instalar e a funcionar pela Resolução CEE 46/1966. Suas atividades tiveram início em abril de 1967. Inicialmente recebeu o nome de Colégio Técnico e Industrial de Limeira, tendo como sua mantenedora a Unicamp, com atividades nas instalações do Ginásio Estadual Industrial Trajano Camargo, em Limeira-SP. Em 1973 o Colégio passou a ocupar o atual campus I da Unicamp em Limeira, ao lado da Faculdade de Tecnologia (FT). Atualmente, forma técnicos em Edificações, Enfermagem, Geodésia e Cartografia, Informática, Mecânica e Qualidade e Produtividade. Em 2005, passou a oferecer os cursos técnicos concomitantes ao ensino médio ou subsequentes a quem já tinha concluído aquela etapa escolar. O objetivo geral do COTIL é proporcionar ao estudante a formação necessária para desenvolver suas potencialidades como elemento de auto-realização, preparação para o trabalho e exercício consciente da cidadania.

Prevista nos Estatutos da Unicamp, baixados pelo Decreto Estadual 52.255/1969, a CGU iniciou suas atividades junto com a própria Universidade. De acordo com o regimento interno da instituição, sua principal função inicial era concatenar as atividades das Coordenadorias Gerais dos Institutos e das Faculdades, bem como coordenar as atividades do Hospital das Clínicas (HC), do Centro de Tecnologia (CT) e do órgão incumbido do registro e controle do corpo discente. Atualmente, a CGU tem como meta acompanhar as ações acadêmicas e administrativas com relevância estratégica. Contribui com a Reitoria na conciliação e aproximação das ações coordenadas pelas Pró-reitorias visando o cumprimento dos objetivos específicos da administração, das unidades de ensino e pesquisa e dos órgãos, para que respondam às perspectivas e necessidades da sociedade. Atua em áreas como transparência, planejamento estratégico, gestão estratégica de dados e avaliação institucional.