O Núcleo de Política Científica e Tecnológica (NPCT) foi criado através da Portaria GR-172/1983, junto à Reitoria. Vinculado ao Instituto de Geociências (IG), teve seu regimento aprovado por intermédio da Deliberação CONSU-A-009/1992. Tinha como finalidade desenvolver estudos em política científica e tecnológica, e apoiar a criação de um curso de pós-graduação de natureza interdisciplinar em política científica e tecnológica. No escopo do núcleo, estavam o acompanhamento e a avaliação da política científica e tecnológica nacional e internacional, com base nas transformações do sistema de geração de pesquisas para os diferentes segmentos econômicos e sociais. Foi extinto pela Deliberação CONSU-176/1996.

O Núcleo de Pesquisas em Telemática foi criado junto à Reitoria por meio da Portaria GR-029/1982, destinado a promover estudos e pesquisas relacionados às aplicações de recursos da informática, da computação e dos meios de comunicação às práticas correntes de ensino e pesquisa dentro e fora do âmbito universitário. O propósito foi criar condições para que a conexão com a sociedade brasileira fosse composta por valores da cultura nacional e adaptada ao desenvolvimento científico e técnico do país. O Núcleo seguia os princípios fixados no artigo 2º da Portaria GR-025/1982.

Criado junto à Reitoria pela Portaria GR-157/1985, o Núcleo de Pesquisas e Estudos da Imagem (NUPIM) estava destinado a promover estudos e pesquisas interdisciplinares relacionados com a geração, processamento, tratamento e classificação de imagens, assim como o desenvolvimento de metodologias e tecnologias ligadas à sua utilização em diversas áreas do conhecimento. Com a Portaria GR-036/1989, a denominação do núcleo mudou para Núcleo de Ciência, Aplicações e Tecnologias Espaciais (NUCATE).

Criado junto à Reitoria pela Portaria GR-27/1982, está atualmente subordinado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN). De acordo com a Deliberação CONSU-A-009/2013, foi instituído com a finalidade de desenvolver atividades de pesquisa de natureza interdisciplinar, tanto pela inserção simultânea em distintas áreas do conhecimento, como pelo concurso de profissionais de diferentes origens e formação. Sua ênfase está na pesquisa, porém em decorrência da sua trajetória no estudo aplicado das políticas públicas, desenvolve consultoria e de atividades extensionistas. O NEPP realiza estudos de implementação, execução e avaliação das políticas públicas em diferentes frentes, como saúde, educação e enfrentamento da pobreza, em âmbitos federal, estadual e municipal. Há programas integrados de formação de gestores públicos em áreas específicas, com o objetivo específico de elaborar políticas públicas.

Inicialmente denominado Núcleo de Estudos e Pesquisas em Informática Biomédica, foi criado junto à Reitoria por meio da Portaria GR-191/1983. Subordinado posteriormente à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN), o NIB tinha por objetivos, de acordo com a Deliberação CONSU-A-030/1991, promover o avanço de conhecimento interdisciplinar em todos os campos relacionados com a informática aplicada à biologia e às ciências da saúde, realizar e difundir pesquisas próprias ou em convênio com outras instituições, colaborar na criação e funcionamento de cursos de graduação, pós-graduação, especialização, extensão e treinamento. Foi extinto em 2004.

No momento em que os computadores entravam nas escolas de ensino fundamental e médio do país, a criação do Núcleo de Informática Aplicada à Educação (NIED) aconteceu pela Portaria GR-139/1983. O NIED foi institucionalizado através da Deliberação CONSU-A-31/1991 e está atualmente vinculado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN). As pesquisas sempre acompanharam todo o avanço e ações da informática no Brasil, com foco na aplicação de tecnologias de informática e comunicação voltadas para contextos de ensino-aprendizagem presencial e remoto. Kits pedagógicos, acessibilidade, robótica pedagógica com custo acessível, educação à distância sempre estiveram no escopo do NIED, por meio de projetos como Educom, Teleduc, Ambiente Lego-Logo, Dafe, Tidia-Ae, Time, E-Cidadania e Mapa Tátil Sonoro (MTS).

O Núcleo de Estudos Regionais (NER) foi criado pela Portaria GR-348/1985, diretamente subordinado à Reitoria e integrado ao Centro de Memória Unicamp (CMU). Tinha por finalidade a realização e divulgação de pesquisas e estudos de natureza interdisciplinar. Suas atividades eram desenvolvidas a partir dos fundos documentais que compõem o acervo do CMU, privilegiando como objeto de estudo a região historicamente conhecida como Oeste Paulista. Em 1990 foi aprovada sua fusão com o CMU por meio da Deliberação CONSU-172/1990.

Criado pela Portaria GR-048/1984 e subordinado à Reitoria, o Núcleo de Estudos Psicológicos (NEP) foi instituído para promover estudos, pesquisas e verificação experimental e teórica em todos os campos relacionados com as Ciências Psicológicas. Foi extinto pela Deliberação CONSU-176/1996.

CInstituído pela Portaria GR-059/1985, o Núcleo de Estudos Estratégicos (NEE) foi criado para promover estudos e pesquisas interdisciplinares sobre o aparelho militar, questões de estratégia e relações internacionais. De acordo com a Deliberação CONSU-A-010/1993, que alterou o regimento interno do órgão, suas atividades se concentraram nas áreas de Forças Armadas e Estado, Estratégica e Política Internacional. A partir de 1998, passou a compor a Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN). De acordo com a Deliberação CONSU-A-007/2002, que dispôs sobre o regimento interno, seus objetivos naquele momento seriam baseados na divulgação de conhecimentos e participação em debates nacionais sobre a história dos exércitos e da guerra, estratégia, defesa nacional e relações de força no plano internacional. Foi extinto pela Deliberação CONSU-347/2009.

O Núcleo de Estudos e Pesquisas em Automação Industrial foi criado como órgão complementar, subordinado à Reitoria, por intermédio da Portaria GR-293/1983. De acordo com a Portaria GR-068/1984, que define sua estrutura e seus objetivos, o NAI promoveria estudos e pesquisas interdisciplinares em todos os campos relacionados com a automação de processos industriais e suas implicações tecnológicas, econômicas, sociais e humanas. Como atribuição, o NAI também deveria promover a conexão entre a Unicamp e órgãos governamentais, instituições de ensino e centros de pesquisa. Foi extinto em 1990, por meio da Deliberação CONSU-172/1990, conforme Relatório de Avaliação dos Núcleos e Centros de 1988, apresentado pela Comissão de Atividades Interdisciplinares (CAI).